بررسی تنوع ژنتیکی در ژرم پلاسم برنج با استفاده از نشانگرهای مولکولی ریزماهواره

thesis
abstract

بررسی ساختار تنوع ژنتیکی در ذخایر گیاهی، یکی از قدم های اولیه در اکثر برنامه های اصلاحی می باشد. در این پژوهش شباهت های ژنتیکی و تجزیه ی خوشه ای به کمک هفده نشان گر مولکولی ریزماهواره بر روی 140رقم برنج روی کروموزوم های 1 تا 12 مورد ارزیابی قرار گرفت. هدف از این تحقیق تعیین تنوع بین ارقام با استفاده از داده های مولکولی جهت استفاده در برنامه های اصلاحی آینده می باشد.dna ژنومی استخراج شده از نمونه های گیاهی با آغازگرهای مربوط به 17 جایگاه ریزماهواره تکثیر و محصول حاصل با استفاده از ژل اکریل آمید الکتروفورز شد. در مجموع تعداد 49 نوار چند شکل در 140رقم مورد مطالعه مشاهده شد. از 17 آغازگر، 16 آغازگر پلی-مورفیسم و یک آغازگر (rm239) مونومورف بوده است. شاخص تنوع ژنتیکی نی (nei) و میزان هتروزیگوسیتی بر اساس ضریب تشابه جاکارد به روش upgma به دست آمد. با استفاده از نرم افزار ntsys تجزیه خوشه ای داده ها ارزیابی شد. بیشترین تشابه ژنتیکی بین ارقام اصلاح شده و ارقام خارجی و کمترین آن بین ارقام محلی و ارقام خارجی بود. pic (polymorphic information content) محتوی اطلاعات پلی مورفیسم برای هر آغازگر با استفاده از نرم افزار microsatellite tools for excel محاسبه شد. میانگین میزان pic، 434/0 می باشد. بر اساس این تحقیق نشانگرهای ریزماهواره ابزار قدرتمندی جهت بررسی تنوع ژنتیکی ارقام و تفکیک آن ها از یکدیگر می باشند.

First 15 pages

Signup for downloading 15 first pages

Already have an account?login

similar resources

ارزیابی تنوع مولکولی و روابط ژنتیکی و تعیین ساختار جمعیت ژرم پلاسم نیشکر ایران با استفاده از نشانگر ریزماهواره

با توجه به پتانسیل‌های موجود در گیاه نیشکر از لحاظ تولید انرژی و قند، بهترین راه برای استفاده از ظرفیت‌های موجود در گیاه نیشکر، بررسی تنوع ژنتیکی واریته‌های موجود جهت به کارگیری در برنامه‌های به نژادی می‌باشد. با مطالعه 30 جفت آغازگر ریزماهواره روی 160 واریته نیشکر، 169 آلل، با میانگین 6/5 آلل برای هر آغازگر حاصل شد. تعداد آلل موثر بین 06/1 برای مکان ژنی AP-SSR03 و 921/1 در مکان ژنی SMC119CG با...

full text

ارزیابی تنوع مولکولی و روابط ژنتیکی و تعیین ساختار جمعیت ژرم پلاسم نیشکر ایران با استفاده از نشانگر ریزماهواره

با توجه به پتانسیل‌های موجود در گیاه نیشکر از لحاظ تولید انرژی و قند، بهترین راه برای استفاده از ظرفیت‌های موجود در گیاه نیشکر، بررسی تنوع ژنتیکی واریته‌های موجود جهت به کارگیری در برنامه‌های به نژادی می‌باشد. با مطالعه 30 جفت آغازگر ریزماهواره روی 160 واریته نیشکر، 169 آلل، با میانگین 6/5 آلل برای هر آغازگر حاصل شد. تعداد آلل موثر بین 06/1 برای مکان ژنی AP-SSR03 و 921/1 در مکان ژنی SMC119CG با...

full text

ارزیابی تنوع ژنتیکی ژرم پلاسم نخود (Cicer arietinum L) با استفاده از نشانگر مولکولی SSR

شناخت تنوع ژنتیکی و طبقه‌بندی ذخایر توارثی (ژرم‌پلاسم) از فعالیت‌های مهم و ضروری در به‌نژادی و مدیریت حفظ ذخایر ژنتیکی گیاهان می‌باشد. در این آزمایش تنوع ژنتیکی 48 ژنوتیپ نخود با استفاده از 38 جفت نشانگر ریزماهواره مورد ارزیابی قرار گرفت. پس از استخراج DNA ژنومی و انجام واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز، آغازگرها در مجموع 117 باند چندشکل تولید نمودند که متوسط تعداد باند چندشکل به ازای هر آغازگر 5/3 بود...

full text

ارزیابی تنوع ژنتیکی ژرم پلاسم نخود (Cicer arietinum L) با استفاده از نشانگر مولکولی SSR

شناخت تنوع ژنتیکی و طبقه‌بندی ذخایر توارثی (ژرم‌پلاسم) از فعالیت‌های مهم و ضروری در به‌نژادی و مدیریت حفظ ذخایر ژنتیکی گیاهان می‌باشد. در این آزمایش تنوع ژنتیکی 48 ژنوتیپ نخود با استفاده از 38 جفت نشانگر ریزماهواره مورد ارزیابی قرار گرفت. پس از استخراج DNA ژنومی و انجام واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز، آغازگرها در مجموع 117 باند چندشکل تولید نمودند که متوسط تعداد باند چندشکل به ازای هر آغازگر 5/3 بود...

full text

بررسی تنوع مولکولی توده‌های مختلف برنج هاشمی شمال کشور با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره

 توده­های محلی برنج ایران از دیرباز در نقاط مختلف برنج­خیز کشور کشت می­­شوند. این توده­ها طی سالیان متمادی به شرایط محیطی مختلف سازگار شده­اند و در نتیجه تنوع نسبتاً زیادی ممکن است در هر کدام از توده­ها مشاهده شود. از چندین سال پیش تا کنون، کشت رقمی به نام هاشمی که از ارقام محلی برنج ایرانی است، رایج شده است، به­طوری­که بیشتر سطح زیر کشت استان گیلان و بخشی از نواحی استان مازندران و حتی برخی از ا...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


document type: thesis

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده علوم پایه

Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023